MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Erwinia sp. Ejp617 plasmid pJE03

Total Repeats: 112

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017443	CGG	2	6	77	82	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785442
2	NC_017443	ATT	2	6	97	102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385785442
3	NC_017443	TGC	3	9	122	130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785442
4	NC_017443	ATG	2	6	131	136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785442
5	NC_017443	CCCTG	2	10	171	180	0 %	20 %	20 %	60 %	385785442
6	NC_017443	GGA	2	6	186	191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385785442
7	NC_017443	CGT	2	6	229	234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785442
8	NC_017443	GCC	2	6	322	327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785443
9	NC_017443	CTGGA	2	10	340	349	20 %	20 %	40 %	20 %	385785443
10	NC_017443	GCA	2	6	351	356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785443
11	NC_017443	ACC	2	6	397	402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385785443
12	NC_017443	GGC	2	6	711	716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785444
13	NC_017443	TCT	2	6	728	733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385785444
14	NC_017443	ACG	2	6	752	757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785444
15	NC_017443	CGGC	2	8	774	781	0 %	0 %	50 %	50 %	385785444
16	NC_017443	CCG	2	6	794	799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785444
17	NC_017443	CGG	2	6	861	866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785444
18	NC_017443	GC	3	6	877	882	0 %	0 %	50 %	50 %	385785444
19	NC_017443	CCG	2	6	1302	1307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785445
20	NC_017443	CGA	3	9	1323	1331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785445
21	NC_017443	CTC	2	6	1405	1410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385785445
22	NC_017443	GCC	2	6	1427	1432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785445
23	NC_017443	CTT	2	6	1440	1445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385785445
24	NC_017443	CGG	2	6	1452	1457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785445
25	NC_017443	CTG	2	6	1465	1470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785445
26	NC_017443	CGACCG	2	12	1614	1625	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	385785446
27	NC_017443	CAG	2	6	1648	1653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785446
28	NC_017443	ACA	2	6	1697	1702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385785446
29	NC_017443	CGC	2	6	1707	1712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785446
30	NC_017443	CGACGC	2	12	1734	1745	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	385785446
31	NC_017443	CGCC	2	8	1773	1780	0 %	0 %	25 %	75 %	385785446
32	NC_017443	CGCC	2	8	1827	1834	0 %	0 %	25 %	75 %	385785447
33	NC_017443	TGC	2	6	1835	1840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785447
34	NC_017443	CCG	2	6	1855	1860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785447
35	NC_017443	CAC	2	6	1867	1872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385785447
36	NC_017443	GAA	2	6	1924	1929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385785447
37	NC_017443	GC	5	10	1968	1977	0 %	0 %	50 %	50 %	385785447
38	NC_017443	GCT	2	6	2000	2005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785447
39	NC_017443	CTG	2	6	2008	2013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785447
40	NC_017443	GGTC	2	8	2045	2052	0 %	25 %	50 %	25 %	385785447
41	NC_017443	GCC	2	6	2149	2154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785448
42	NC_017443	GCA	2	6	2190	2195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785448
43	NC_017443	ACT	2	6	2201	2206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385785448
44	NC_017443	CAG	2	6	2212	2217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785448
45	NC_017443	CTG	2	6	2236	2241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785448
46	NC_017443	CCGA	2	8	2248	2255	25 %	0 %	25 %	50 %	385785448
47	NC_017443	CCGC	2	8	2256	2263	0 %	0 %	25 %	75 %	385785448
48	NC_017443	CCG	2	6	2266	2271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785448
49	NC_017443	GCC	2	6	2345	2350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785448
50	NC_017443	GCC	2	6	2383	2388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785449
51	NC_017443	GGT	2	6	2394	2399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385785449
52	NC_017443	GCC	2	6	2405	2410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785449
53	NC_017443	CGA	2	6	2421	2426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785449
54	NC_017443	GCCG	2	8	2449	2456	0 %	0 %	50 %	50 %	385785449
55	NC_017443	GAT	2	6	2478	2483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785449
56	NC_017443	CGA	2	6	2781	2786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785450
57	NC_017443	GC	3	6	2804	2809	0 %	0 %	50 %	50 %	385785450
58	NC_017443	CTG	2	6	2866	2871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785450
59	NC_017443	GCA	2	6	2901	2906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785450
60	NC_017443	GC	3	6	2914	2919	0 %	0 %	50 %	50 %	385785450
61	NC_017443	GCC	2	6	2945	2950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785450
62	NC_017443	GCT	3	9	2952	2960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785450
63	NC_017443	CGGC	2	8	2978	2985	0 %	0 %	50 %	50 %	385785450
64	NC_017443	CTGC	2	8	2997	3004	0 %	25 %	25 %	50 %	385785450
65	NC_017443	AGC	2	6	3017	3022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785450
66	NC_017443	GCC	2	6	3025	3030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785450
67	NC_017443	CGG	2	6	3063	3068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785450
68	NC_017443	CTG	2	6	3121	3126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785450
69	NC_017443	TGG	2	6	3152	3157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385785450
70	NC_017443	CGC	2	6	3176	3181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785450
71	NC_017443	TGA	2	6	3185	3190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785450
72	NC_017443	CGA	3	9	3372	3380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785451
73	NC_017443	GGA	2	6	3846	3851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385785452
74	NC_017443	ACC	2	6	3889	3894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385785452
75	NC_017443	CTG	2	6	3913	3918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785452
76	NC_017443	CTG	2	6	3985	3990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785453
77	NC_017443	GCA	2	6	3999	4004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785453
78	NC_017443	GGC	2	6	4042	4047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785453
79	NC_017443	CGC	2	6	4251	4256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785454
80	NC_017443	CGTG	2	8	4278	4285	0 %	25 %	50 %	25 %	385785454
81	NC_017443	GCG	2	6	4288	4293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785454
82	NC_017443	CGG	2	6	4421	4426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785455
83	NC_017443	CCG	2	6	4476	4481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785455
84	NC_017443	GAC	2	6	4498	4503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785455
85	NC_017443	CAC	2	6	4532	4537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385785455
86	NC_017443	GCT	2	6	4578	4583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785455
87	NC_017443	CTT	2	6	4614	4619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385785455
88	NC_017443	CGG	2	6	4626	4631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785455
89	NC_017443	GCT	2	6	4638	4643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785455
90	NC_017443	GCC	2	6	4670	4675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785455
91	NC_017443	AGC	2	6	4676	4681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785455
92	NC_017443	GCC	2	6	4732	4737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785455
93	NC_017443	GCG	3	9	5023	5031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785456
94	NC_017443	GGT	2	6	5040	5045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385785456
95	NC_017443	GC	3	6	5047	5052	0 %	0 %	50 %	50 %	385785456
96	NC_017443	ACG	2	6	5054	5059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785456
97	NC_017443	TGC	2	6	5060	5065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785456
98	NC_017443	GGT	2	6	5106	5111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385785456
99	NC_017443	GAGCTG	2	12	5140	5151	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385785456
100	NC_017443	GAC	2	6	5152	5157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785456
101	NC_017443	CAGC	2	8	5427	5434	25 %	0 %	25 %	50 %	385785457
102	NC_017443	TTC	2	6	5449	5454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385785457
103	NC_017443	AC	3	6	5477	5482	50 %	0 %	0 %	50 %	385785457
104	NC_017443	GGT	2	6	5670	5675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385785457
105	NC_017443	TGC	2	6	5687	5692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785457
106	NC_017443	GC	3	6	5778	5783	0 %	0 %	50 %	50 %	385785457
107	NC_017443	ACGC	2	8	5806	5813	25 %	0 %	25 %	50 %	385785457
108	NC_017443	GCC	2	6	5822	5827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785457
109	NC_017443	GAT	3	9	6019	6027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785458
110	NC_017443	GATC	2	8	6066	6073	25 %	25 %	25 %	25 %	385785458
111	NC_017443	GTG	2	6	6166	6171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385785458
112	NC_017443	GCT	3	9	6189	6197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785458

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.